目前， 世界各国和地区的政府部门对转基因植物及其产品的管理，主要分为自愿标识和强制性标识管理两个分支，前者有美国、加拿大、阿根廷及中国的香港特区，其他国家和地区大多采用后者。欧盟是最早对转基因食品进行标识管理的。1990年欧盟颁布转基因生物管理法规，确立转基因食品标识管理框架。后要求对所有转基因植物衍生的食品及饲料进行标识，目前将标识的最低限量降低到0.9%，即当食品中某一成分的转基因含量达到0.9%时，必须进行标识。2013年6月，美国东北部的康涅狄格州通过一项有生效前提的法案，要求给转基因食品贴上“用基因工程技术生产”的标识，这是美国第一个强制要求给转基因食品贴标识的州。另有报道说，其他几个州也打算跟进。

但同时不应忽视的是，转基因作物毕竟是人类利用科技改造自然的产物，虽然它对人类生命健康和自然环境的负面影响尚未得到证实，但并不代表将来这些潜在影响不会成为现实。从这个角度考虑，决策部门在推广转基因作物时应该慎之又慎，必须采取周密的措施防止将来发生不可逆转的严重影响。

在这个问题上，发达国家的一些做法可以借鉴。如美国立法规定，每一种转基因食品上市前至少要经过三个部门的审查，农业部负责管理转基因作物的开发和田间试验，环保局负责评估转基因植物的环境影响，药管局则负责转基因食品和饲料的安全性评估。转基因食品上市必须符合传统的食品卫生标准，任何一种转基因食品上市都需要好几年时间，并花费1000万至1500万美元搜集完成审批所需要的数据。

应该看到，转基因作物的推广始终伴随着争议，但也正是这些争议，为加强转基因作物安全性研究、完善相关监管机制提供了源源不断的动力。转基因作物难言完美，人类也不应因噎废食，以科学的态度处理和对待，方是上上之策。

尤为重要的是，科学家应当更成熟地与公众对话。支持本国转基因试验的英国前科学部长洛德·斯坦贝利认为公众对一些科学观念的不信任，并不是因为公众不理解这些科学问题，而是因为公众感觉他们是被强迫接收改变。为了提升争论的层次，他认为政府应该要求像皇家科学会和医学科学院这样的机构来公开评估目前转基因作物的处境，这样政府和公众可以基于最好的科学建议来做出决策。对个人而言，消费者拥有知情权和选择权，是保障转基因作物在市场正常流通，保障消费者受到“公正”对待的基础。